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品牌 | 其他品牌 | 供貨周期 | 一個月 |
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應用領域 | 醫療衛生,環保,化工,生物產業,綜合 |
試劑盒里有什么:
試劑盒含量(10個反應或25個反應):
TGIRT® -III enzyme, 1 x 10 M l (KTGIRT-10) or 3 x 10 M l (KTGIRT-25)
10XPrimer混合物,50 M l (PM-110)
10 x DTT, 50 M l (D-121)
5x反應緩沖區,100 M l (RX-120)
TGIRT® -III enzyme ,a RNA和DNA寡核苷酸的混合 (可退火 形成含有R2RNA/R2R異型基因的 第一個適配器序列 , dithiothreitol (DTT) ,以及 反應緩沖區 去執行 ® 照明rnan及sdnaa-seq分析的模板轉換應。 這個工具包能夠與第一個rna-后續適配器無縫連接到cDNA的5'端,合成rna模板的cDNA副本。為香港及香港的 DNA寡核苷酸 (單獨購買) 第二組子適配器序列 必須加到CDNA的3'端 5'微生物/RNA連接酶 (新英格蘭生物學家;M019或M0319L)在PCR擴增之前。
可以做什么實驗?
1.全面的鏈特異性轉錄組分析。8
2.全細胞、胞外體、血漿和其他無細胞RNA的RNA序列7,8,15
3.miRNA、tRNA和其他非編碼小RNA的分析1-9,12,15
4.RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP和CRAC用于表征RNA-蛋白質相互作用和核糖體圖譜。1,10,115
5.通過高通量測序鑒定RNA堿基修飾。4,5,13,14
6.單鏈DNA-序列16
7.FFPE腫瘤樣本分析(咨詢InGex技術支持)。
以下是您應該使用TGIRT的原因:
比逆轉錄病毒逆轉錄酶具有更高的熱穩定性、持續能力和保真度,允許從高度結構化和/或高度修飾的RNAs(例如tRNAs)和含有富含GC重復擴增的RNAs進行全長、端到端的cDNA合成。1-9,12,15,17
新的端到端模板轉換活性,能夠在逆轉錄過程中連接RNA-seq或PCR接頭,并且不需要單獨的拖尾或RNA 3’-接頭連接步驟。1與使用隨機六聚體引物或使用RNA連接酶進行接頭連接的程序相比,這種模板轉換活性極大地促進了鏈特異性RNA-seq文庫的構建,偏差更小。1,7,8
能夠從低至2 ng的RNA輸入中產生全面的圖譜。7,15
從RNA模板到PCR產物的RNA-seq文庫構建需要不到5小時。7,8,15
TGIRT更適合通過tgi rt-模板轉換構建RNA-seq文庫:
1.全面的鏈特異性轉錄組分析。
去核糖的片段化通用人類參考RNA樣品的TGIRT -seq概括了人類轉錄物和刺突蛋白的相對豐度,與非鏈特異性TruSeq v2相當,且優于鏈特異性Tru-Seq v3。TGIRT -seq比TruSeq v3具有更強的鏈特異性,并消除了TruSeq固有的隨機六聚體引發的取樣偏差。與TruSeq相比,TGIRT -seq顯示了更均勻的5’至3’基因覆蓋范圍,并識別了更多的剪接點。TGIRT -seq能夠在相同的RNA-seq中同時分析mrna和lncRNAs,作為結構化的小ncRNAs,包括trna,它們基本上不存在于TruSeq數據集。8
2.人類全細胞、胞外體、血漿和其他細胞外RNA序列。
快速處理時間(通過PCR步驟構建RNA-seq文庫< 5小時);需要少量RNA(低ng范圍);全面的轉錄譜,包括mRNAs和lncRNAs以及小ncrna,包括tRNAs、前miRNAs和其他結構化小ncrna的全長閱讀;不需要RNA連接酶;與常規方法相比,偏差更小,效率更高,鏈特異性更強。7,8,15
3.高度結構化和/或高度修飾的RNA模板的RNA-seq。
更高的熱穩定性、持續加工性和鏈置換使得獲得tRNAs和其他結構化/修飾的小ncRNAs的全長、端到端cDNAs成為可能,這些小ncRNAs對逆轉錄病毒RTs.4-9,12-15是不可抵抗的。
4.在諸如RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP、CRAC、核糖體分析等方法中通過TGIRT模板轉換構建RNA-seq文庫。
快速處理時間(通過PCR步驟構建RNA-seq文庫< 5小時);需要少量RNA(低ng范圍);不需要RNA連接酶,操作步驟更少,偏差更小,效率更高。1,10,11
5.人血漿和大腸桿菌基因組DNA的ssDNA序列。
通過直接在DNA鏈的3’端啟動DNA合成,同時連接DNA-seq銜接子,無需末端修復、加尾或連接,以更簡單的工作流程捕獲精確的DNA末端。能夠分析核小體定位、轉錄因子結合位點、DNA甲基化位點和來源組織。
上海牧榮生物科技有限公司
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