MagVigen™ – DNA 純化和大小選擇試劑盒可以從各種粗樣品材料(例如 NGS 文庫、PCR 構(gòu)建體)中簡單快速地分離 DNA。它能夠有效回收 DNA 并有效去除不需要的污染物(例如引物、未摻入的 dNTP 和鹽)
使用 Cat# k61001-Easy 的 DNA 文庫清理示例:MagVigen™ Easy DNA Cleanup & Size Selection Kit。
圖 1.對于嚴(yán)重污染的 NGS DNA 文庫樣品(接頭二聚體比率 224%),MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸選擇試劑盒 (K61001-Easy) 的性能優(yōu)于傳統(tǒng)品牌產(chǎn)品。凈化后,使用 MagVigen™(通過質(zhì)量控制 (QC))時(shí)文庫中的接頭二聚體含量低于 3%,而使用 AmPure XP 時(shí)則超過 6%(未通過 QC)。
圖 2.對于嚴(yán)重污染的 NGS DNA 文庫樣品(接頭二聚體比率 186%),MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸選擇試劑盒 (K61001-Easy) 的性能優(yōu)于傳統(tǒng)品牌產(chǎn)品。清理后,文庫上的接頭二聚體減少至 2.3%。
圖 3. MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸選擇試劑盒 (K61001-Easy) 對于中等污染的 NGS DNA 文庫樣品(接頭二聚體比率 68%)也效果更好。凈化后,使用 MagVigen™ 時(shí),文庫中的接頭二聚體含量為 0.45%,而使用 AmPure XP 時(shí)為 1.2%。
圖 4. MagVigen™ Easy DNA 清理和大小選擇試劑盒 (K61001-Easy) 對于日志污染 NGS DNA 文庫樣品(接頭二聚體比率 20%)仍然效果更好。凈化后,使用 MagVigen™ 檢測不到接頭二聚體,而使用 AmPure XP 則檢測不到 0.6%。
MagVigen™ DNA 大小選擇磁性納米粒子和試劑盒經(jīng)過優(yōu)化,可捕獲所需截?cái)啻笮〉?DNA:>50bp、>100bp、>150bp、>200bp、>300bp、>400bp、>500bp、>700bp。
圖 5. MagVigen™ DNA 大小選擇 捕獲所需大小的 DNA 片段。成功捕獲 >500bp、>400bp、>300bp、>200bp 的 DNA 梯輸入。
圖 6顯示了 MagVigen™ 磁珠在三種不同緩沖液條件下對不同大小的 DNA 片段的捕獲效率。成功捕獲 >150bp、>75bp、>35bp 的 DNA 梯輸入。
圖 7.使用 MagVigen™ 珠進(jìn)行的基于非雜交的 DNA 捕獲可在多種溫度條件下使用。
圖 8.一個(gè)用例。客戶要求 200bp 截止值和與 A 公司 XP 珠子相同的方案。我們可以將 MagVigen™ 視為 XP 的替代品: 1. 在相同的比率、相似的產(chǎn)量下,MagVigen™ 實(shí)現(xiàn)了更高的保真度。 XP捕獲了很多100bp。 2. 從比率 0.8 可以看出,向后趨勢(向上 0.8)MagVigen™ 具有更高的靈敏度。