樣品應至少稀釋 2 倍,以避免出現(xiàn)稱為“樣品基質(zhì)效應"(SME) 的現(xiàn)象,這是非線性稀釋響應和不準確數(shù)據(jù)的常見原因。當樣品中的蛋白質(zhì)或其他成分影響抗體與其靶分子結(jié)合的能力時,就會發(fā)生這種情況。例如,蛋白質(zhì)可能與目標分子結(jié)合,從而阻斷抗體的結(jié)合位點(圖 4A)。中小企業(yè)是已知和未知原因的結(jié)果。然而,通過適當?shù)臉悠废♂專|(zhì)效應可以忽略不計(圖 4B)。最佳稀釋度會根據(jù)樣品類型、實驗和目標分子而有所不同;因此,在運行整個實驗之前,用一些樣品優(yōu)化實驗條件非常重要。一種可能不需要稀釋的樣品類型是尿液,因為它的蛋白質(zhì)含量非常低。
對于血清和血漿以外的樣品,樣品稀釋前的原始總蛋白濃度應至少為 1 mg/ml。然而,建議總蛋白濃度高于 2 mg/ml 以改善信號。這些濃度不包括可與條件培養(yǎng)基樣品一起使用的任何血清(例如胎牛血清)。重要的是,使用濃度低于 1 mg/ml 的條件培養(yǎng)基樣品仍可實現(xiàn)陣列上的高信噪比,因為上清液的蛋白質(zhì)含量低于細胞和組織。個體之間血清和血漿中的蛋白質(zhì)濃度范圍很窄,平均總蛋白質(zhì)濃度約為 70 mg/ml。
不同的細胞和組織含有不同量的蛋白質(zhì)。因此,加載到陣列上的細胞、組織和樣品的量必須憑經(jīng)驗確定。盡管如此,良好的起點是:每 100 萬個細胞或 10 mg 組織使用 500 µL 裂解緩沖液,在 100 mm 組織培養(yǎng)板中接種約 100 萬個細胞,并培養(yǎng) 5 天作為培養(yǎng)基樣品。
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