PCR儀已經成為分子生物學、醫學、食品工業、司法科學、生物技術、環境科學、微生物學、臨床診斷、流行病學、遺傳學、基因芯片、基因檢測、基因克隆、基因表達等領域廣泛應用的一種實驗室儀器。
PCR擴增儀直接影響臨床檢測結果的準確性、重復性、甚至工作效率。PCR儀器品牌的選擇,是首先關系到實驗進行是否出現故障的重要因素,你知道選購PCR儀要進行哪些篩選嗎?
一、溫度控制
對普通PCR儀來說,溫度控制主要是指溫度的準確性、均勻性、以及升降溫速度,對梯度PCR儀來說,除了溫度的準確性和均勻性、升降溫速度以外,還必須考慮儀器在梯度模式和標準模式下是否具有同樣的溫度特性。
溫度的準確性是指樣品孔溫度與設定溫度的一致性,它直接關系到實驗的成敗。如果排除樣品加入過程中的問題,對于PCR反應而言最重要的莫過于溫度控制的準確性,由于PCR是一個幾何級數擴增的過程,擴增過程中退火溫度的細微變化會被放大而直接影響結果,不論是變性、退火還是延伸都需要準確控制溫度,對退火溫度而言溫控顯的尤為重要,有時1度甚至0.5度的差異也能決定實驗的成功與失敗,所謂差之毫厘,謬之千里。因而對PCR擴增儀而言溫度控制就意味著質量。
溫度的均勻性是指樣品孔間的溫度差異,它關系到在不同樣品孔進行反應結果的一致性。我們在實驗中發現有時用同樣的樣品,同樣的PCR反應程序,最后的結果竟然差異非常明顯,或許就是因為不同位置的溫度不均一性所致。一些使用過早期PCR儀的腦子格外靈光的研究人員偏愛使用PCR儀中間某幾個固定的孔,就是因為過往反復的教訓和認真的思索得出了這樣的結論,PCR儀的溫度均勻性不好,特別是最外周的樣品孔情況更差,很有可能影響實驗結果-即“位置的邊緣效應”會影響結果的可重復性。正是這種位置效應對定量PCR的結果的影響更為明顯。
溫度控制除了精確度,還有一個廠家喜歡大力宣傳的指針-升降溫的速度。更快的升降溫速度,可以縮短反應進行的時間,而且縮短了可能的非特異性結合、反應的時間,能提高PCR反應特異性。因此從本質而言溫控方式就從以前相對穩定耐用的機械式轉向了升降溫更快速的半導體。除了機械本身的原因,影響升降溫速度的還有制作承托樣品管的基座模塊的材料的導熱性。
二、儀器的功能性和人性化設計
熱蓋:現在的PCR儀一般均配備熱蓋,熱蓋溫度設為105℃,使樣品管頂部的溫度達到105℃左右,蒸發的反應液就不會產生凝集在管蓋上而改變反應體積,這樣用戶就無需再向反應管內加石蠟油,直接減少后繼操作的麻煩。如果是旋轉加壓的熱蓋就要特別小心,因為壓力到達時沒有明顯的提示,用戶需要根據經驗將熱蓋旋到合適位置,不太容易掌握。如果過松,熱蓋沒有充分接觸反應管而影響結果;如果過緊,則會導致反應管變形,甚至可能造成熱蓋的機械故障。
樣品基座:PCR反應多在0.2或者0.5的管子中進行,多數PCR儀也配備了不同的可更換樣品槽適配不同的樣品管。
軟件:新的PCR儀都比較注重程序編寫的簡易性。大屏幕,顯示實時信息,倒計時,記憶存儲多個程序、自動斷電保護等都有助于實驗室中的復雜環境使用。